I 1924 blir den norske regjeringen presset til å inngå en hemmelig avtale som gir Sovjetunionen herredømmet over Svalbard i 2020. Men etter en dramatisk katt og mus-lek fra Kristiania til Moskva forsvinner avtalen under uklare omstendigheter. Deretter går den i glemmeboken.
 
Så dukker avtalen uventet opp igjen mer enn nitti år senere. I en tid hvor et aggressivt Russland ønsker å være stormakt også i Arktis. Den russiske presidenten setter i verk en plan for å undergrave Norges suverenitet på Svalbard og Longyearbyens kvinnelige prest kommer i sentrum for en fiendtlig etterretningsoperasjon. Men hun finner seg ikke i å være offer, og det viser seg at selv en hardbarket russisk agent kan ha en akilleshæl.
 
I snart et århundre har Svalbard vært den ømme tåen i norsk utenrikspolitikk. Om hundre år er allting gjemt er en internasjonal spenningsroman som speiler den politiske konflikten som ble skapt allerede da Svalbardtraktaten ble inngått i 1920, og som kan blusse opp igjen når verdens øyne nå er rettet mot Arktis. Den er også en roman om lojalitet og svik.